产品描述:
磁珠法高分子量DNA片段分选纯化回收试剂是AMD公司开发制备的新产品。主要是针对高分子量基因组DNA(HMW DNA)的纯化和大小选择。用于快速去除HMW DNA样品中的小片段DNA, 工作适用范围是5kb至100kb或以上。 使用操作和NGS文库DNA片断分选过程类似,只需调整试剂与样本的体积比,即可从高分子量 DNA 样本中快速去除长度 <5kb、<10kb、<20kb 或 <30kb 的 DNA 片段至痕量水平,同时可回收所需的大尺寸 DNA 片段:>5kb、>10kb、>20kb 或 >30kb。满足第三代测序平台对 DNA 样本的要求。适用于如PacBio SMRT Technology 或Oxford Nanopore Technology.的测序平台。是一款全新且真正可实现对高分子量基因组DNA(HMW DNA)的纯化和大小选择的产品。按照该产品常规操作规程,每个检测需要约65-75微升试剂。
产品组份和性状:
为黑褐色磁颗粒悬液。磁珠分散均匀,具有超顺磁性。磁相应时间<20s。 批次间差异小于5%,重复性好,稳定性好。
应用领域:
可用于5kb至200kb范围高分子量DNA的分段选择,回收和纯化。
储存条件:
2-8℃ 保存。 切勿冷冻。
注意事项:
该产品仅适用于科学研究,请勿用于人体实验。
常见问题及回答:
Q: 什么是高分子量DNA片段分选?
A: 高分子量DNA 片段大小选择是针对大于5kb以上的高分子量基因组DNA(HMW DNA)的纯化和大小选择。适用于如PacBio SMRT Technology 或Oxford Nanopore Technology.的测序平台。
Q:Auto-Mag® HMW Size Select(磁珠法高分子量DNA片段分选纯化回收试剂)工作原理是什么?
A:是基于固相可逆固定化(SPRI (Solid Phase Reverse Immobilization))的原理,配合特定的缓冲液,选择性地将高分子量核酸与顺磁珠结合。去除HMW DNA样品中的小片段DNA,从而实现纯化回收特定范围大小的高分子量DNA。, 工作适用范围是5kb至100kb或以上。
Q: 高分子量DNA片段分选纯化回收试剂工作流程?
A: 主要分有4步:
1.混合:将高分子量DNA片段分选纯化回收试剂与 gDNA 样本混合。
2.结合:与样本混合时,高分子量DNA片段分选纯化回收试剂的纳米磁珠会与所需的 DNA片段结合。这种相互作用依赖于高分子量DNA片段分选纯化回收试剂中的化学成分的浓度比例,高分子DNA分子与磁珠纳米粒子表面之间的多种因素,例如电荷-电荷相互作用、亲水/疏水相互作用和其他分子间的引力。
3.清洗:磁珠对磁场作出反应(通过使用磁铁,例如磁分离架),使结合的DNA能够快速有效地与样本的其余部分分离。通过抽吸去除未结合的材料,剩下的是磁珠纳米粒子结合的DNA。
4.洗脱:从纳米磁珠粒子中释放结合的核酸片段。选定的 DNA 样本已准备好用于下游应用。
Q:Auto-Mag® HMW Size Select分选试剂的主要用途是什么?
A:主要应用于第三代高通量测序高分子量DNA片段的纯化和分选。去样品中除短 DNA 片段、杂质和不需要的反应成分。
Q:磁珠法高分子量DNA片段分选纯化回收试剂可以重复使用吗?
A:不可以重复使用。
Q:磁珠法高分子量DNA片段分选纯化回收试剂可以纯化基因组 DNA (gDNA)吗?
A: 磁珠法高分子量DNA片段分选纯化回收试剂就是专门为高分子量基因组DNA片段分选设计的。可以进行高分子量DNA片段产物的纯化。并可根据加入的试剂于DNA样品体积的比例变化,纯化回收不同大小范围的DNA片段。例如:1.5×磁珠可以吸附 大于5kb 以上的高分子量DNA,清除掉小于5kb的DNA片段。1.35×磁珠可以吸附 20 bp 以上的DNA产物,而清除小于20kb的DNA片段,等等。详细请参考Auto-Mag® HMW Size Select分选试剂操作手册。
Q:磁珠法高分子量DNA片段分选纯化回收试剂回收DNA大小偏差的可能的原因是什么?
A: 常见原因包括:
1)操作误差。高分子量DNA分选试剂对于试剂和样品之间的混合比例十分敏感。操作时应确定加样器的准确性。
2)磁珠和样品比例不对。请按照说明书进行选择合适的比例。
3)磁珠与DNA混匀不充分,未能充分吸附。需充分混匀反应体系。
4)吸附孵育时间偏短。,请保证孵育时间至少10 分钟。
5)磁珠丢失。磁珠分选时,丢弃上清或用乙醇洗涤磁珠时触及到了磁珠,导致部分磁珠随吸弃液体时被丢弃。请在移液过程中防止吸到磁。;
6)洗涤用的乙醇浓度偏低。建议洗涤用乙醇浓度不低于80%。
7)磁珠干燥过度。磁珠长时间干燥导致DNA难以正常洗脱,得率降低;建议干燥时间不宜过长。
8)洗脱液体积不足。使用合适体积的洗脱液,洗脱液应可完全覆盖管内磁珠团块。
Q. 磁珠法高分子量DNA片段分选纯化回收试剂的DNA结合能力多少?
A: 大于40ug/mg
Q:磁珠法高分子量DNA片段分选纯化回收试剂是否可以用于提取gDNA?
A:不可以。
Q: 磁珠法高分子量DNA片段分选纯化回收试剂在室温下放置了很长时间。还能使用吗?
A: 该试剂在室温下稳定。但长期保存,仍建议放4-8oC保存。详细请参阅操作手册。
Q: Auto-Mag® HMW Size Select(磁珠法高分子量DNA片段分选纯化回收试剂)市场定位?
A: Auto-Mag® HMW Size Select Kit 可用于多种高分子量DNA样本类型,在文库制备之前去除短 DNA 片段,从而提高 DNA 样本质量,并显著增强第三代测序平台(如 PacBio SMRT 技术或 Oxford Nanopore 技术)的平均读取长度。
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