产品描述:
Auto-Mag® DTR (磁珠法测序产物纯化试剂)是基于超顺磁纳米磁珠和特殊缓冲液优化配置而成。能够特异性结合Sanger测序反应中的所有片段。通过三个简单步骤:结合,洗涤和洗脱,从Sanger测序反应混合物中去除多余的引物二聚体,盐和未结合的染料终止剂,快速完成测序产物的纯化。纯化后的产物可直接进行3730XL等遗传分析仪进行测序。Auto-Mag® 磁珠法测序产物纯化试剂具有的高灵敏度和结合能力,可降低BigDye®化学试剂的使用浓度,信号强且均匀,背景噪音极低,实现更长的连续读取长度。 与基于Sephadex 的纯化试剂相比,Auto-Mag® 测序产物纯化试剂操作过程操作简单快速,无需离心,不仅适合手工操作处理样品,而且可适用于当前市场上的自动化平台进行高通量纯化。
产品组份和性状:
为黄褐色磁颗粒悬液
操作性能好,磁珠分散均匀,具有超顺磁性,磁相应时间<10s
稳定性及批次间重复性好:粒径均一,呈单分散;保存稳定性好。
应用领域:
Sanger测序反应产物纯化。适合ABI和MegaBACE测序仪。
储存条件:
2-8℃ 保存。 切勿冷冻。
注意事项:
该产品仅适用于科学研究,请勿用于人体实验。
常见问题及回答:
Q: 什么是Sanger测序纯化?
A: Sanger 测序产物纯化是指在进行 Sanger 测序上机之前从 测序反应的PCR 产物中去除多余的未结合引物和 dNTP 的过程,这对于防止测序反应中使用的染料标记物的干扰来确保高质量的序列数据至关要。
Q: Auto-Mag® DTR(磁珠法测序产物纯化试剂)工作原理是什么?
A: 是基于超顺磁纳米磁珠能够特异性结合Sanger测序反应中的所有片段。去除多余的引物二聚体,盐和未结合的染料终止剂,快速完成测序产物的纯化。
Q: 为什么在测序之前需要清理 测序反应产物?
A: 测序的PCR 反应中残留的未结合引物和 dNTP 会干扰测序过程,因为这些物质可能会干扰后续反应并导致序列无法读取。
Q: 常用的Sanger 测序产物纯化方法有那些?
A: 常用方法有以下几种:
1. 乙醇沉淀:一种传统方法,价格便宜,但是相当耗费时间。并可能导致一些 DNA 损失。
2. 旋转柱纯化:利用带有硅基膜的市售试剂盒选择性结合 DNA,同时去除污染物。
3. 酶清理:某些酶可以特异性地降解未结合的引物和 dNTP。成本偏高,效果不稳定。
4. 纳米磁珠纯化:快速,方便,可实现大规模自动化纯化。
Q:即使只看到凝胶上的一条DNA带,也需要清理我的 PCR 产物吗?
A: 是的,即使凝胶上的一条带也可能含有足够的过量引物和 dNTP,从而对测序质量产生负面影响。
Q: 如果不清理PCR 产物会发生什么?
A: 可能会遇到测序质量差的情况,如碱基识别不明确、“染料斑点”或难以准确确定序列。
Q: 我可以使用标准 PCR 清理试剂盒进行 Sanger 测序吗?
A: 是的,大多数市售 PCR 清理试剂盒可以用于 Sanger 测序模板制备。
Q: 选择测序产物纯化方法时应考虑什么?
A: 主要涉及:
1. 样品量:选择与您的 PCR 反应量兼容的试剂盒。
2. 吞吐量:如果您需要清理大量样品,请考虑自动化选项。
3. 成本:比较不同试剂盒之间的每个样品价格。
Q: 如何知道我的纯化是否成功?
A: 测序质量:具有清晰峰值的高质量序列数据表明清理成功。
Q: 测序产物回收效率不高的原因是什么?
A: 常见有以下几种:
1. 测序PCR反应产物质量不高。确定使用正确的反应模板和引物。
2. 洗脱不充分。洗脱液的pH应是7.0-8.0。酸性的洗脱液会降低洗脱效率。
3. 磁珠没有充分重悬。洗脱时,确定充分悬浮磁珠。
4. 磁珠过分干燥。过分干燥会影响洗脱效率。过分干燥后,延长洗脱时间,以提高洗脱效率。
5. 操作过程中磁珠有丢失。延长磁珠富集时间。在富集期间用移液枪轻轻混合2-3 次提高富集效果。
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